Niguliste muuseum hoiab, uurib ja tutvustab keskaegset ja varauusaegset kirikukunsti.
Muuseum paikneb 13. sajandil rajatud Niguliste kirikus ja on üks väheseid Põhja-Euroopa muuseume, mis asub endises sakraalhoones, võimaldades kirikukunsti esitleda selle ajaloolises kontekstis. Muuseumi tähtteosteks on Põhja-Saksa ja Madalmaade hiliskeskaegsed retaablid ning Bernt Notke maalitud „Surmatants” 15. sajandi lõpust. Eriliselt väärtuslik on Hõbedakambris eksponeeritud kirikute ning gildide-tsunftide ja Mustpeade vennaskonna hõbevara.
Alates 2023. aastast on muuseumis esmakordselt publikule avatud klaaslift ja uus taevakorrus ajaloolises kirikutornis. Läbi kolme korruse kulgev lift viib taevakorrusele, kust avaneb ainulaadne vaade Tallinnale.